Dyrektor
- Zastępca Dyrektora
- Zastępca Dyrektora
- Zastępca Dyrektora
- Główny Księgowy
I. PION DOKUMENTACJI I ZARZĄDZANIA WIEDZĄ O ZABYTKACH:
1. Dział Ewidencji i Rejestru Zabytków, w skład którego wchodzą:
- Zespół ds. zabytków nieruchomych
- Zespół ds. zabytków ruchomych
- Zespół ds. zabytków archeologicznych
2. Dział Dokumentacji i Baz Danych o Zabytkach, w skład którego wchodzą:
- Zespół ds. rozwoju i wdrażania technologii informatycznych
- Zespół ds. inwentaryzacji zabytków
3. Dział Kształcenia i Wydawnictw, w skład którego wchodzą:
- Zespół ds. organizacji kształcenia i upowszechniania wiedzy o dziedzictwie
- Zespół ds. wydawnictw
4. Biblioteka
5. Zespół ds. Archiwaliów
II. PION ANALIZ I STRATEGII ZARZĄDZANIA DZIEDZICTWEM
1. Dział Ekspertyz i Analiz Konserwatorskich, w skład którego wchodzą:
- Zespół ds. ekspertyz i analiz zabytków nieruchomych
- Zespół ds. ekspertyz i analiz krajobrazu i zieleni zabytkowej
- Zespół ds. ekspertyz i analiz zabytków archeologicznych
2. Dział Strategii Zarządzania Dziedzictwem, w skład którego wchodzą:
- Zespół ds. standardów badań i ochrony dziedzictwa
- Zespół ds. analiz uwarunkowań prawnych ochrony dziedzictwa
- Zespół ds. światowego dziedzictwa
- Zespół ds. dziedzictwa niematerialnego
3. Oddziały Terenowe:
- w Białymstoku
- w Gdańsku
- w Katowicach
- w Kielcach
- w Krakowie
- w Lublinie
- w Łodzi
- w Olsztynie
- w Opolu
- w Poznaniu
- w Rzeszowie
- w Szczecinie
- w Toruniu
- w Warszawie
- we Wrocławiu
- w Zielonej Górze
4. Pracownia Terenowa „Park Mużakowski” w Łęknicy
III. PION ORGANIZACYJNY
1. Biuro ds. Administracyjnych
2. Biuro ds. Zamówień i Inwestycji
3. Biuro ds. Realizacji Programów Specjalnych
4. Samodzielne Stanowisko ds. Obsługi Prawnej
5. Samodzielne Stanowisko ds. BHP
6. Samodzielne Stanowisko ds. Obronnych
oraz pozostałe komórki organizacyjne i samodzielne stanowiska pracy:
1. Biuro ds. Komunikacji
2. Biuro ds. Personalnych
3. Pełnomocnik Dyrektora ds. Ochrony Informacji Niejawnych
4. Samodzielne Stanowisko ds. Audytu i Kontroli
5. Biuro ds. Finansowych